Seniorforsker i Bioinformatik til Statens Serum Institut

Statens Serum Institut (SSI) søger en ambitiøs og erfaren seniorforsker, der kan bidrage til vores forskningsindsats inden for mikrobiel genomanalyse og smitsomme sygdomme. Som en del af vores forskerteam vil du få mulighed for at lede brede og essentielle projekter og indgå i et tværfagligt miljø med fokus på at bekæmpe nogle af de mest udbredte sundhedsudfordringer vi står over for.

Om Afdelingen for Sekventering og Bioinformatik
Afdeling for Sekventering og Bioinformatik på SSI er en del af det nationale diagnostiske infektionsberedskab og varetager opgaver indenfor sekventering og bioinformatiske analyser af en lang række sygdomsfremkaldende mikroorganismer. Afdelingen består af ca. 25 medarbejdere, hvori forskning er en helt essentiel komponent. VI vil gerne styrke vores forskning og søger derfor en seniorforsker til projekter omkring mikrobiel evolution og adaptation. I stillingen vil der være tæt samarbejde med de øvrige akademikere i afdelingen og bredere på SSI.

Din hverdag hos os
Som seniorforsker vil du have en central rolle i at styrke vores forskningsindsats inden for mikrobiel genomanalyse og smitsomme sygdomme.

Dit arbejde vil spænde over flere centrale områder, hvor du vil få ansvar for både strategiske og operationelle opgaver. Først og fremmest vil du få mulighed for at arbejde med:

• Etablering og ledelse af forskningsprojekter
  : Initiere, planlægge og lede projekter, der fokuserer på analyse af mikrobielle genomer, selektion og sygdomsudbrud.
• Vejledning og supervision
  : Støtte og vejlede studerende samt nye medlemmer af forskergruppen i deres arbejde.
• Vidensformidling
  : Aktivt dele forskningsresultater internt og eksternt, både på instituttet og i internationale fora gennem publikationer og konferencer.

Din uddannelse, erfaring og personlige kvalifikationer
Du har en relevant akademisk uddannelse indenfor bioinformatik, molekylær mikrobiologi eller lignende. Derudover har du en dybdegående forståelse for mikrobielle genomer, dataanalyse og formidling. Erfaring og kvaliteter der vil være gavnlige for at lykkes i stillingen:

• Ph.D.
  i mikrobiologi eller lignende felt med fokus på genomanalyser.
• Post-Ph.D. erfaring
  i en stilling med aktiv forskningsaktivitet og dokumenteret samarbejde på tværs af faggrupper.
• Hands-on erfaring med værktøjer til analyse af genomsekvenser, herunder kvalitetskontrol, kurering af genomdata, og automatiserede rapporter og pipelines.
• Enpublikationsliste
  , der afspejler erfaring med ovenstående områder.

For at få succes i denne stilling kræver det, at du har en solid og relevant faglig baggrund. Vi ser derfor efter en kandidat, der har omfattende erfaring inden for flere områder:

• Mikrobielle genomanalyser
  : Erfaring med diverse sekventeringsteknologier (NGS, long- og short-read, WGS og amplicon-sekventering) og anvendelse af state-of-the-art værktøjer til indgående analyser.

• Fylogenetiske analyser
  : Dygtig til at udføre og fortolke fylogenetiske analyser for at kortlægge evolutionen af mikrobielle patogener.
• Udbrudsanalyser
  : Dokumenteret erfaring med at overvåge og analysere sygdomsudbrud ved brug af genomdata.
• Håndtering af store datasæt
  : Kompetent i at administrere og analysere store, komplekse datamængder, herunder opbygning og kurering af databaser.
• 
  og værktøjer til både forskning og overvågning.

Programmering af bioinformatiske pipelines
: Erfaring med at udvikle og implementere automatiserede pipelines og værktøjer I R, Python og bash til genom analyser og udvikling og tilpasning af pipelines

• Evolutionær mikrobiologi
  : Bred forståelse af evolution og medicinsk mikrobiologi, med evne til at formidle denne viden til samarbejdspartnere.
• International vidensdeling
  : Stærke kommunikationsevner og erfaring med at præsentere forskning på internationale konferencer, i tværfaglige samarbejder, og med en aktiv publikationshistorik.

Vi tilbyder
Et spændende og udfordrende job, på et internationalt anerkendt institut, hvor faglig udvikling, sparring og oplæring prioriteres højt. Hverdagen er præget af udfordringer, spændende data og med et mål om at gøre en forskel – et opsæt hvor samarbejde med flere faggrupper er en nødvendighed.

Vi er en familievenlig arbejdsplads med en 37 timers arbejdsuge inkl. frokostpause. Derudover har vi bl.a. en aktiv idrætsforening med motionslokaler og en personaleforening. Vi er centralt beliggende i København med gode offentlige transportmuligheder (bus og metro).

Om ansættelsen
Du bliver ansat som Seniorforsker efter gældende overenskomst mellem Skatteministeriet og Akademikernes Centralorganisation.

Med henblik på bedømmelse af de forskningsmæssige kvalifikationer indsendes en publikationsliste og 3-5 videnskabelige arbejder. De forskningsmæssige kvalifikationer vil blive bedømt af et fagkyndigt udvalg nedsat i henhold til gældende stillingsstruktur for videnskabeligt personale med forskningsopgaver ved sektorforskningsinstitutioner.

Kontakt os gerne
Få mere at vide om stillingen ved at ringe til Afdelingsleder Marc Stegger på 3268 8141 eller [email protected].

Er du interesseret?
Klik på "søg stillingen" og send os din ansøgning med CV og eksamensbevis.

Afdeling:

Lokation: Artillerivej 5, København S, Danmark